F. prausnitzii es la única especie conocida de este genero de bacterias. Es anaeróbica, aumenta el sistema inmune y es una de las bacterias comensales más abundantes e importantes de la microbiota intestinal humana, en adultos sanos representa más del 5% de las bacterias en el intestino.
Tiene como papel fundamental la producción de ácidos grasos de cadena corta (AGCC), en especial de ácido butírico, el cual juega un importante papel en la nutrición y el trofismo del epitelio intestinal, así como en la inhibición de la inflamación de la mucosa de la pared intestinal. Estos AGCC sirven de alimento a LactobacillusLactobacillus son bacterias anaerobias facultativas y acidificantes que colonizan principalmente el estómago y el intestino... y BifidobacteriumSon bacterias anaerobias y acidificantes que colonizan principalmente el intestino grueso. Destacan en la producción..., y cubren el 10% de los requerimientos energéticos del organismo.

La microbiota intestinal de las personas bipolares contiene aproximadamente un tercio menos de bacterias del grupo Faecalibacterium. Esta bacteria también está subrepresentada en otras afecciones, tales como el síndrome del intestino irritable, la enfermedad de Crohn, la colitis ulcerosa, el cáncer colorrectal y la diarrea crónica idiopática, o en ancianos y / o en pacientes hospitalizados frágiles, así como en personas depresivas.
En un estudio se vio que cuanto menos abundante era Faecalibacterium en la microbiota, más pronunciados eran los síntomas del trastorno por déficit de atención con o sin hiperactividad (TDAH), también se han asociado con, la obesidad y el asma. Con niveles más altos de lo habitual se han asociado con psoriasis.